過比丘戒後，三大寺和噶廈官員不滿攝政王第穆呼圖克圖，藉口“神意”，要求攝政王第穆呼圖克圖辭任，讓他親政。攝政王第穆呼圖克圖無法可施，只得同意。當年八月初八這一天，在布達拉宮的司西彭措大殿上，舉行了隆重的親政大典。

他親政後，並未完全掌握大權。他比任何人都瞭解西藏政壇上的複雜性。他從九、十、十一、十二世**喇嘛分別在十一、二十二、十八、二十歲時被毒害或神秘死亡的史實中，深知西藏內部的權力鬥爭的激烈程度。於是，他不動聲色。他親政後的第四年，一個“反對十三世**的陰謀”被揭露，第穆呼圖克圖之弟傲布才仁等人對他親政不滿，企圖將他害死，擁其兄第穆呼圖克圖攝政。噶廈逮捕了傲布才仁等人，傲布才仁等人供認不諱。已下臺的攝政王穆呼圖克圖聞訊後大驚失色，當天晚上，在自己靜修的丹結林寺“暴病”而亡。從此之後，十三世**喇嘛才真正掌握了西藏大權。

而此時，中華大地也已經風雲突變。

先是辛亥**清朝滅亡，然後中華民國成立，而後在經歷了“贛寧之役”和日本的入侵之後，成立了短暫的“中華帝國”，而在“再造共和”之後，中華民國又得以恢復，緊接著是日本的第二次入侵……

中國政局的持續動盪，使西藏也變得風雨飄搖。

英國對西藏步步逼近的歷史，總是時不時的刺激著十三世**喇嘛的神經。

早在七世**喇嘛圓寂的那一年，即藏曆第十三“饒回”年，英國東印度公司的一支英國遠征軍擊敗了印度莫臥兒王國副王率領的印度軍隊後，最終控制了印度次大陸。喜馬拉雅山脈北面富於傳奇色彩的大清帝國治下的西藏，成了英帝國又一個垂涎目標。最初是在乾隆三十九年，東印度公司派遣二十二歲的波格爾入藏，在日喀則見到了六世班禪，但當時的八世**喇嘛和攝政王拒絕了他到拉薩的請求，使波格爾無功而返。清嘉慶十六年，英夷曼寧到了拉薩，九世**喇嘛接見過他，但未給英國人任何機會。但沒過多久，這種情況悄然發生了變化。當時除廓爾喀外，位於中國與印度兩國之間的喜馬拉雅山脈南麓地帶，還存在著哲孟雄、不丹、達拉克等一系列奉清朝為宗主國的地方小王國或部落，1814年，英帝國趁廓爾喀和哲孟雄兩國紛爭之機，出兵幫助哲孟雄，廓爾喀奮起反擊，將英印軍隊驅出國境。次年，英印軍隊再次大舉進攻，廓爾喀向清朝求救，清朝駐藏大臣不但不出兵相救，反而斥責廓爾喀，面對侵略者的大軍，廓爾喀當局走投無路，只好向英國殖民者求和。此次戰爭後，英國殖民者開啟了覬覦西藏的視窗。…；

就是在他出生前一年，英國利用馬嘉理在雲南被殺事件，強迫清朝簽訂《煙臺條約》，其間規定英夷可由四川、青海入藏。到光緒六年，即他五歲那年，英國人企圖利用該條約由四川入藏，西康巴塘藏民武裝自發將其阻攔。光緒十一年，英國又派馬可倫由哲孟雄入藏，仍被阻而返。

**記得最清楚的一件事，就是在他十二歲那年，英國卵翼下的哲孟雄與西藏發生衝突，西藏軍隊進入清朝屬國哲孟雄，英印當局派出了一支用現代化槍炮武裝起來的軍隊侵入哲孟雄。清朝軟弱無能，不但不斥責英印當局的侵略行徑，反而要求藏軍撤出自己的屬地哲孟雄。他和噶廈在清朝駐藏大臣文碩的支援下，決定抗擊英印軍。清朝政府下令將文碩撤職。但他和噶廈仍不顧清政府反對，下令藏軍與英印軍展開了激戰，但由於武器裝備過於落後，藏軍遭到失敗。他緊急從全藏調集了軍隊和民兵趕到前線，當藏軍路過拉薩時，年僅12歲的他親自為每一位戰士摸頭祝福，同時，還在布達拉宮召集喇嘛唸經，詛咒英印軍失敗。這年6月，三千藏軍向英印軍反攻，再次遭到失敗。10月，萬餘藏軍再次向英印軍反攻，手持大刀長矛的藏軍遭到英印軍開花大炮的猛轟，死傷慘重，被迫退回西藏，得勝後的英印軍囚禁了哲孟雄國王，並攻入西藏，迫使噶廈簽訂降約，自此割佔了哲孟雄。用刺刀大炮開啟西藏的大門，第一次抗英戰爭就這樣陷於失敗。

由於西藏的局勢已變得岌岌可危，面對英印當局咄咄逼人的侵略態度和清朝的軟弱，**感到西藏危亡已近，這時，沙俄政府對他和西藏表示友好，經德爾智牽線後，一個西藏代表團訪問了莫斯科，受到沙皇尼古拉二世的親自接見，雙方關係日趨密切。

沙俄的介入使英國大為驚恐，英國決心搶在沙俄之前動手，1902年，兩百多名英印軍以查界為名，侵入西藏，沙俄向英印當局擔出“抗議”，早已視西藏為自己的勢力範圍的英印當局惱羞