到繼承他王位的女婿圖坦卡蒙身上。圖坦卡蒙是愛赫那頓的弟弟，說明這樁婚姻是叔叔與侄女之間的婚姻。

圖坦卡蒙以他那莊嚴精美的金面具聞名天下。他被迫重新恢復多神崇拜，並且還從阿瑪爾那（又名“愛赫那頓”）遷都到孟斐斯，最後遷都底比斯。即便如此可能依然不能平衡各方政治力量，他在17歲被謀殺了。

愛赫那頓與圖坦卡蒙的母親是位黑人。這位名叫Queen　Tiye的埃及王后是努比亞公主。她在大約1391年嫁給阿蒙霍特普三世，共有三子（Amenhotep　IV　［Akhenaton］；　Smenkhare；　和　Tut…ankh…amen）。在風雨飄搖中據說一直是她在支撐著這個國家。這個王后儘管是個黑人，但據說漂亮而慷慨，有很高聲望。

由於這一血統，從一些埃及彩色壁畫上可以明顯看出愛赫那頓的女兒是黑人，愛赫那頓本人明顯沒有白人特徵。這一時期，古埃及人的膚色概念並不強，經常發生不同種族間的混血。閃含兩族的混血結果使得埃及人看起來基本上同中國人一樣。

14世紀是埃及帝國動盪不安同時也充滿迷惑不解的一個時期。許多人懷疑愛赫那頓就是以色列領袖摩西，原因之一當然是因為他們基本同期，同時他們倆都以倡導“一神教”而聞名。愛赫那頓以世界上第一個“一神教”的倡導者而著稱，他的一神是“太陽神”——阿頓（Aton）。之前埃及人信仰的是多神崇拜。有人說，他在政治與宗教改革失敗後，以“摩西”的名義逃亡了。假如是這樣的話，那麼就說明愛赫那頓是以色列