，太子與為布衣之交。數陳規諷，又獻《侍臣箴》，甚有弘益。時太子起西池樓觀，頗為勞費，嶠上疏以為朝廷草創，巨寇未滅，宜應儉以率下，務農重兵，太子納焉。王敦舉兵內向，六軍敗績，太子將自出戰，嶠執鞚諫曰：“臣聞善戰者不怒，善勝者不武，如何萬乘儲副而以身輕天下！”太子乃止。

明帝即位，拜侍中，機密大謀皆所參綜，詔命文翰亦悉豫焉。俄轉中書令。嶠有棟樑之任，帝親而倚之，甚為王敦所忌，因請為左司馬。敦阻兵不朝，多行陵縱，嶠諫敦曰：“昔周公之相成王，勞謙吐握，豈好勤而惡逸哉！誠由處大任者不可不爾。而公自還輦轂，入輔朝政，闕拜覲之禮，簡人臣之儀，不達聖心者莫不於邑。昔帝舜服事唐堯，伯禹竭身虞庭，文王雖盛，臣節不愆。故有庇人之大德，必有事君之小心，俾方烈奮乎百世，休風流乎萬祀。至聖遺軌，所不宜忽。願思舜、禹、文王服事之勤，惟公旦吐握之事，則天下幸甚。”敦不納。嶠知其終不悟，於是謬為設敬，綜其府事，幹說密謀，以附其欲。深結錢鳳，為之聲譽，每曰：“錢世儀精神滿腹。”嶠素有知人之稱，鳳聞而悅之，深結好於嶠。會丹陽尹缺，嶠說敦曰：“京尹輦轂喉舌，宜得文武兼能，公宜自選其才。若朝廷用人，或不盡理。”敦然之，問嶠誰可作者。嶠曰：“愚謂錢鳳可用。”鳳亦推嶠，嶠偽辭之。敦不從，表補丹陽尹。嶠猶懼錢鳳為之奸謀，因敦餞別，嶠起行酒，至鳳前，鳳未及飲，嶠因偽醉，以手版擊鳳幘墜，作色曰：“錢鳳何人，溫太真行酒而敢不飲！”敦以為醉，兩釋之。臨去言別，涕泗橫流，出閣復入，如是再三，然後即路。及發後，鳳入說敦曰：“嶠於朝廷甚密，而與庾亮深交，未必可信。”敦曰：“太真昨醉，小加聲色，豈得以此便相讒貳。”由是鳳謀不行，而嶠得還都，乃具奏敦之逆謀，請先為之備。

及敦構逆，加嶠中壘將軍、持節、都督東安北部諸軍事。敦與王導書曰：“太真別來幾日，作如此事！”表誅奸臣，以嶠為首。募生得嶠者，當自拔其舌。及王含、錢鳳奄至都下，嶠燒硃雀桁以挫其鋒，帝怒之，嶠曰：“今宿衛寡弱，徵兵未至，若賊豕突，危及社稷，陛下何惜一橋。”賊果不得渡。嶠自率眾與賊夾水戰，擊王含，敗之，復督劉遐追錢鳳於江寧。事平，封建寧縣開國公，賜絹五千四百匹，進號前將軍。

時制王敦綱紀除名，參佐禁固，嶠上疏曰：“王敦剛愎不仁，忍行殺戮，親任小人，疏遠君子，朝廷所不能抑，骨肉所不能間。處其朝者恆懼危亡，故人士結舌，道路以目，誠賢人君子道窮數盡，遵養時晦之辰也。且敦為大逆之日，拘錄人士，自免無路，原其私心，豈遑晏處，如陸玩、羊曼、劉胤、蔡謨、郭璞常與臣言，備知之矣。必其兇悖，自可罪人斯得；如其枉入奸黨，宜施之以寬。加以玩等之誠，聞於聖聽，當受同賊之責，實負其心。陛下仁聖含弘，思求允中；臣階緣博納，幹非其事，誠在愛才，不忘忠益。”帝從之。

是時天下凋弊，國用不足，詔公卿以下詣都坐論時政之所先，嶠因奏軍國要務。其一曰：“祖約退舍壽陽，有將來之難。今二方守禦，為功尚易。淮泗都督，宜竭力以資之。選名重之士，配徵兵五千人，又擇一偏將，將二千兵，以益壽陽，可以保固徐豫，援助司土。”其二曰：“一夫不耕，必有受其飢者。今不耕之夫，動有萬計。春廢勸課之制，冬峻出租之令，下未見施，惟賦是聞。賦不可以己，當思令百姓有以殷實。司徒置田曹掾，州一人，勸課農桑，察吏能否，今宜依舊置之。必得清恪奉公，足以宣示惠化者，則所益實弘矣。”其三曰：“諸外州郡將兵者及都督府非臨敵之軍，且田且守。又先朝使五校出田，今四軍五校有兵者，及護軍所統外軍，可分遣二軍出，並屯要處。緣江上下，皆有良田，開荒須一年之後即易。且軍人累重者在外，有樵採蔬食之人，於事為便。”其四曰：“建官以理世，不以私人也。如此則官寡而材精。周制六卿蒞事，春秋之時，入作卿輔，出將三軍。後代建官漸多，誠由事有煩簡耳。然今江南六州之土，尚又荒殘，方之平日，數十分之一耳。三省軍校無兵者，九府寺署可有並相領者，可有省半者，粗計閒劇，隨事減之。荒殘之縣，或同在一城，可併合之。如此選既可精，祿俸可優，令足代耕，然後可責以清公耳。”其五曰：“古者親耕藉田以供粢盛，舊置藉田、廩犧之官。今臨時市求，既上黷至敬，下費生靈，非所以虔奉宗廟蒸嘗之旨。宜如舊制，立此二官。”其六曰：“使命愈遠，益宜得才，宣揚王化，延譽四方。人情不樂，遂取卑品之人，虧辱國命，生長患害。故宜重其選，不可減二千