移到河北紮營，逼近起義軍。起義軍趁勢發起攻擊，多隆阿派騎兵截殺，起義軍撤走。多隆阿的騎兵追到長陀灣。

10月19日，多隆阿揮軍進攻起義軍精銳部隊集結地蘇家溝，連戰四天，於10月22日攻克蘇家溝，斬殺五千名起義軍，還抓獲大批俘虜。接著進軍渭城灣，斬殺一萬七千人，起義軍大部西奔甘肅。

總督熙麟呆在甘肅東部邊界的慶陽，護總督恩麟則呆在西邊的蘭州，起義軍所到之處，沒有清軍阻攔，平涼和固原一帶，井舍都成廢墟。

陶茂林在眉縣擊敗四川的順天軍，進攻眉縣以東的槐芽鎮和白家凹，攻佔了起義軍的堡壘，然後挺進西北方，逼近鳳翔，在七里河修築壁壘，鳳郡的形勢平靜下來。知府張兆棟因防守鳳翔而出名。清廷將陶茂林提拔為甘肅提督，多隆阿改任西安將軍，三十七歲的天津人曹克忠出任河州鎮總兵。

曹克忠領兵渡過渭河，攻擊白起營和馬家埠，佔領這兩處以後，關輔一帶稍稍平靜。

清廷再次下詔，催促多隆阿派兵增援甘肅。陶茂林奉命拔營越過隴縣，揮師北上，與雷正綰部一起攻打平涼。

11月17日，四川順天軍攻佔周至。11月28日，曹克忠的部隊在白吉原打了個大勝仗，起義軍西奔固原。11月29日，雷正綰部從永壽北上邠州，也就是現在所說的彬縣。起義軍解圍西撤。

從此以後，陝西的回民起義軍為了避免與多隆阿軍交戰，逐漸向西邊轉移。

這時，寧夏府發生了漢民與回民的爭鬥，兵備道侯登雲訓練民團守備。將軍慶瑞認為應該安撫，上奏彈劾侯登雲，勒令安民團練部隊繳械。這裡的寧夏府，就是現在所說的銀川。

12月4日，回民起義軍攻佔寧夏府城，侯登雲喪命，漢民全被斬殺。慶瑞就在幾里之外的滿城，置若罔聞。

12月5日，靈州回民起義，佔領州城，攻進滿人軍營，繳獲大量物資，捆載而去。這個靈州，就是現在寧夏自治區的吳忠。

清廷得到報告後，頒下嚴旨，斥責慶瑞，催促熙麟趕赴蘭州接受總督官印。又命令陝西巡撫英桂調撥一千名湘軍駐紮陝西與寧夏交界處的定邊，命令直隸總督劉長佑挑選兩千人組成的勁旅，由提督訥欽統領，增援寧夏。

自從1862年陝西發生回民起義以後，起義軍派人四出聯絡，於是甘肅東北部義軍四起，在靈州與固原之間的同心城，以及同心城東南方約一百里處的預旺城，都有回民舉起義幟。同州城西南約三十里處有個金積堡，###教哲派第五代教主馬化龍在這裡舉起反清義旗，設立碉卡，訓練部隊。

起義軍攻佔寧夏府城後，姓赫的首領派使者迎接馬化龍進城，回民們跪在道路左側，俯首聽命。

馬彥龍和馬佔鰲在蘭州西南約兩百里處的和州起義，向東進軍，攻佔狄道，即現在所說的臨洮。在蘭州以西，則有馬桂源和馬本源在西寧起義，趕走總兵和知府。馬桂源自任西寧知府，馬本源自封西寧鎮總兵，辦事大臣玉通無法制止。後來馬文祿佔據肅州，即現在所說的酒泉，自稱兵馬大元帥。蘭州東南方的岷縣、渭源、臨洮和東方的安定、會寧、靜寧，以及西南部的循化，都有回民起義。甘肅從西到東，都燃起了起義的火焰。

面對甘肅全省的起義軍，多隆阿感到兵力不足。他得知湘軍在江蘇已對天京合圍，東南戰事漸漸順利，便請清廷讓兩江總督和巡撫抽調兵力趕赴陝西，並且催促石清吉的湘軍向西開進。

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多隆阿的部隊一直在西安周邊作戰，由於多隆阿本人一直是抱病指揮，而清廷還要他兼顧甘肅的軍事，因此他對於陝西南部的起義軍，實在是無力兼顧。

駱秉章推薦的能人李雲麟，由於母親去世，迴歸鄉里。清廷將陝西南部的軍務交給劉蓉指揮。8月12日，清廷命令駱秉章派部隊跟隨劉蓉增援陝西南部。8月15日，清廷任命劉蓉為陝西巡撫。在劉蓉到任之前，由陝西按察使張集馨代理職務。

1863年，同治二年（17）

清廷命令劉蓉率領先後增援陝西的所有部隊，先去解漢中之圍。漢中是個繁榮富裕的大郡，自從四川順天軍會同陳玉成的殘部，與當地起義軍聯合，環城修建軍營，城內已是壁壘森嚴。

毛震壽膽小怕事，藉口軍餉難以為繼，辭去官職。援軍中都是武將，拿不出對策，互相觀望，讓起義軍有了喘息的時間。順天軍佔據洋縣以後，已經引得幾十萬名起義軍從湖北開來，直接進軍漢中。毛震壽率部駐紮漢中東北方五十里處的城固