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傅斯年向胡適分析，為什麼大家都願意將票投給胡適的原因，並將顧孟餘的“落選”，視為一群讀書人“自由意志”的展現與學術*的結果：

此番經過，無組織，無運動，在翁、任請客外，亦未聚商，三五人閒談則有之耳。舉先生者之心理，蓋大多數以為只是投一廢票，作一個demonstration，從未料到政府要圈您也。我輩友人，以為蔡先生之繼承者，當然是我公，又以為從學院之身份上說，舉先生最適宜，無非表示表示學界之正氣、理想、不屈等義，從未想到政府會舍翁、朱而選您。我初到渝時，曾經與雪艇（按：王世傑）、書詒（按：段錫朋）談過舉你一票事，他們都說，“要把孟餘選出，適之也必須選出，給他們看看”，當時可以說是沒有人料到照顧到你。此會全憑各人之自由意志，而選出之結果如此，可見自有公道，學界尚可行democracy！

傅斯年也指出，這一群讀書人的考慮純粹是學術的而與政治無涉，因此即便“忤旨”，和蔣介石的指示“南轅北轍”，亦在所不顧：“所以我們的意思，只是‘正經事，正經辦’，且不惜忤旨（不舉顧），以為此事至少決不至於忤及中國之大academician兼自由*主義之代表者也！”

傅斯年並討論了朱家驊得票多而王世傑毫無所得的原因，這裡就不詳說了。

選舉次日，王世傑向蔣介石報告了結果，蔣的反應也很有趣：“……雪艇遇到介公，以顧未選及三人結果陳明，介公笑了一下。次日語孔（按：孔祥熙）雲，‘他們既然要適之，就打電話給他回來罷’。此真出人意外。大約朱、翁二人，亦皆以此忤旨，派他們設法舉顧出來，而未辦到，偏舉上自己……”

孔祥熙當時深受蔣介石信任，“權傾一時”，早思染指對美外交事務，一聽到蔣介石說同意胡適卸任駐美大使回國擔任中研院院長，立即有所動作；諸方則深知胡適擔職關係重大，不能輕易放棄，否則必任憑孔祥熙為所欲為，於是也就極力折中，希望可以“兩全其美”：

介公此說一出，於是孔乃立即推薦四人，其人皆不堪。此後我即加入運動先生留在美任之友人中，曾為此事數訪嶽軍（按：張群），並請萬不得已時，先設法發表一代理人，最好是翁，以便大使改任一事停頓著（此節雪艇知之詳）。然我們如此想著，亦是為國家，在先生則似不應當生到選舉人的氣。其後一想，“學院的自由”，“*的主義”，在中國只是夢話！但是把先生拉入先生的主義中，卻生如許枝節，亦是一大irony！書　包　網　txt小說上傳分享

第一章　開創學術的自主空間（6）

當然，幾經活動，胡適依舊留任駐美大使，未讓孔祥熙遂其所願；可是，對選舉結果表面上“笑了一下”的蔣介石，其實耿耿於懷，於是中研院院長人選竟然在一時之間“難產”，橫遭困難。

如果是軍政大員無視蔣介石的手令，蔣未必可以奈其何；至於一群手無寸鐵的讀書人的忤逆其旨，竟將蔣介石心目中的人選顧孟餘棄諸度外，“龍心大怒”的他，得以採取的“報復”手段，可就多了，先將三位院長候選人的名單放在一邊，置而不決，始終不做圈選，不過只是小小伎倆。幾經爭取，一直到了1940年9月18日，朱家驊方始特派受命為研究院的代理院長，於9月20日就職。研究院院長的人選，虛懸半年之久，至此才告塵埃落定。可是呢，朱家驊這一代理，就代理了十七年，一直到他於1957年10月辭職為止，從來沒有真除扶正過。蔣介石用這樣的手段，“回報”一群讀書人維護“學術獨立”的選擇。

作為最高政治威權，蔣介石總想在一切領域插手管事，遂其所欲，關於中央研究院院長繼任者這件事，他依例“下條子”指定人選。在過往的時代氣候裡，蔣介石的手令，簡直就像是“御旨”，沒有多少人敢逆龍麟，捋虎鬚，“抗旨”以對。可是，中央研究院評議會的評議員既不是隻曉得“等因奉此”的公務員，也不是蔣介石的直屬部下，非得奉命唯謹不可。在學術的世界裡，哪裡有蔣介石的手令“頤指氣使”的空間呢？顯然，就像陳寅恪“大發揮其academic　freedom說”一般，他詠唱的學術自由的高昂音調，也是其他的評議員共遵同守的信念。蔣介石的手令，在這群讀書人看來，無足道焉，根本不是不能忤