年秋天，一次寒潮襲來，他突然感到身體與往年大不一樣了，特別是腸胃方面明顯有許多不適。有一次在辦公室，他連續多次進出廁所，這引起了王秘書的注意。王秘書看到他臉色蒼白，以為他是因為工作勞累過度，對他說：“詹先生，事情總是幹不完的，您還是要注意身體啊。”

詹天佑說：“是啊，我也想好好休息，可是現在有很多事情要處理，除了漢鄂川鐵路的事情外，交通部也轉來很多事情。不過，我感到有些事情是令人高興的。比如關於我國東北的中東鐵路問題，俄國因為國內發生革命，我國應該想辦法爭取收回那裡的路權，我覺得現在應該是一個比較好的機會，但是，令人擔心的是英美法日四國竟然插手東北的鐵路。”

王秘書說：“中國這麼大，那麼多鐵路，您哪能顧得過來呀。我看您近來身體不是很好，我的意見是您還是要注意休息。”

接下來幾天，詹天佑的腸胃問題越來越嚴重了，他不得不聽從王秘書的意見，到醫院治療。可是令詹天佑沒有想到的是，由於他長年累月奔波在鐵路線上，他的腸胃問題不是一時半會積累起來的，而是長時間形成的，所以，吃了醫生的藥也只能是時好時壞。或者是夫妻連心，詹天佑的身體問題讓本來就身體羸弱的譚菊更加擔心起來，譚菊珍的肺病也因此變得嚴重以來，以至到了冬天，譚菊珍竟然病得臥床不起。

在北京方面，北洋政府內部的權力鬥爭還在暗流湧動，儘管黎元洪已經去職，但繼任總統馮國璋與國務總理段祺瑞的矛盾還在不斷激化，最後，馮國璋不得不辭職，由段祺瑞支援的勢力選舉徐世昌當上*政府的國家總統。

徐世昌是一個文人，雖屬袁世凱的北洋派系，但沒有樹什麼敵人。他當選總統後，也進行了一次大型的勳章頒獎典禮。在1918年10月10日的國慶日，徐世昌給對國家建設有貢獻的各方面人物頒發獎章，詹天佑因為他對全國交通立法和鐵路建設方面的貢獻，被徐世昌授予二等寶光嘉禾章。獲獎的訊息多少給了詹天佑一些安慰，詹天佑親自到北京領獎，同時，又一次到京綏鐵路的現場向鄺景陽瞭解工程進展情況，並對工程問題提出了自己許多看法，此時他雖然沒有在京綏鐵路任職，但他對京綏鐵路的關注一直沒有停過，因為這條鐵路最初就是由他開始籌建的。鄺景陽見到詹天佑臉色蒼白，特別是瞭解到他患有頑固的腸胃病後，他建議詹天佑到北京郊外的湯山溫泉進行一段時期的療養。他感到自己的身體確實問題比較嚴重，接受了鄺景陽的建議，到湯山溫泉進行了幾天的療養，但是，在療養的時候，他心中非常惦記著臥病在床的妻子，所以，儘管湯山溫泉的醫生建議他多停留些時日，他還是提前回到了武漢。

好訊息總是一個接著一個，1918年11月11日，德國政府代表埃爾茨貝格爾同協約國聯軍總司令福煦在法國東北部貢比涅森林的雷東德車站簽署停戰協定，德國投降。詹天佑和他的同仁們武漢得到這個訊息，他與大家一樣感到歡欣鼓舞，在他看來，歐戰結束後，世界局勢將會安定，以前簽訂的借款合同應該可以履行，這幾年來他一直用心推動的漢粵川鐵路將會迎來一個新的建設時期，他特地在漢粵川鐵路公所舉行了一次慶祝酒會，歡慶協約國的勝利，因為中國是協約國的一方。

作者題外話：在北京方面，北洋政府內部的權力鬥爭還在暗流湧動，儘管黎元洪已經去職，但繼任總統馮國璋與國務總理段祺瑞的矛盾還在不斷激化，最後，馮國璋不得不辭職，由段祺瑞支援的勢力選舉徐世昌當上*政府的國家總統。