軍士官學校步兵科。當時日本培養軍官，多從教導團的下士之中，選拔優秀者，送入士官學校。荒尾精從軍，本是有備而來，吃苦耐勞，而且此前的學問底子十分紮實，因此如願入選。在軍校的兩年時間，荒尾精與20　多個志同道合的同學結成一個小團體，經常在一起探討〃興亞〃大計，習武強身，聞名全校。他刻苦攻讀，將應修的課程以及軍事知識，掌握得十分透徹，順利畢業並獲得陸軍少尉軍銜。這時，他再度顯露不同常人的思路。士官學校畢業生，一般都做著日後當上將軍元帥之類的從軍夢，但荒尾精志不在此，在朝鮮發生壬午兵變後，他就希望能到中國去一展他的〃興亞〃抱負，於是，奔走託告，希望能辭去軍職，渡海赴華。

當時的陸軍大臣大山岩接見了他，聽他陳述興亞志願，大山岩問他：〃目今青年有為之士，大都爭往歐美留學，　足下何以獨欲赴固陋之極的中國呢？〃

他說：〃惟其因為大家都醉心歐美而置中國於不顧，所以我想到中國去。〃他解釋自己到中國去，是要〃略取中國，然後施仁政，以圖復興亞細亞〃。

日本陸軍因為荒尾精剛畢業，便不許他辭職，將他派往熊本去擔任第十三聯隊的隊副。根據日本史料，他在任內十分稱職，得到士兵們的擁戴，在部隊中很有點名望。但懷抱鴻鵠之志的荒尾精十分鬱悶，感慨〃東亞大局日非，何日宿志得伸〃，〃中國距日本僅一衣帶水，然身似籠中之鳥，無法展翅高飛，徒然對四百餘州（指中國）魂牽夢縈，嗚呼！〃〃　組織〃上儘管感覺他不安心〃本職工作〃，但對他還是十分器重的。

荒尾精並未放棄努力。在熊本服役期間，他遇上了也在軍中擔任中文教官的御幡雅文。御幡雅文是日本外務