此整頓人事就成了當務之急。這件事讓高拱來做，真是最合適不過。他可謂第一流的吏部尚書，一到部，便立即召開全體司官會議，沒有寒暄，沒有廢話，一上來就亮出了手中的寶劍。

他首先嚴厲批評了二百年來實行的，徒具形勢的人事考績制度，認為三年一考，三考才論黜陟，而九年之間，官員有因死亡、丁憂、事故而去職的，亦有因仕途順暢而一升再升的，既難久任，如何可以在原職九年而待三考？因此，所謂考績云云，便成為只有升而無降，是‘考績黜幽之典廢’。更荒謬的是，每當考察之時，所發落的官員之數，前後不相上下，其數未足則必找補，其數已足即不復問。高拱犀利的質問一干吏部官員道：“天下間豈有六年之間，不肖者皆有定數？可知不過是有人為了苟且了事罷了！”令一干官員羞愧難當。

但高拱從來不給瀆職者面子，他進一步指出道：“即使那些被認定為不肖的官員，吏部也不過是苛求隱細、虛應故事；而真正大奸大惡者，卻不敢問而佯作不知，乃至顛倒黑白，反稱高潔。這樣的考察，不過是‘縱虎狼於當路，覓狐鼠以塞責，此人心所為不服也！’”

針對以上情況，他要求吏部自今以後，第一，必須因事用人、不能因人設職；強調唯才是舉、因材酌用，不許庸碌貪婪者濫竽充數、渾噩官場；第二，強調言功罪以定遷黜，提倡以實心行實政，辦實事；第三，不以科舉出身名次作為用人的主要標準，而是根據業績破格用人。

為此，高拱反覆嚴申人事紀律，諸如：凡已經領取任命而不到任之官，一律免職降用；對經查實有據的貪汙官員，不許再朦朧復職；而對於雖被科道彈劾之員，仍必須核實證據後再做處置；對冗員一律裁革；對於偽冒官員者，嚴懲不貸；對吏部官員犯法，罪加三等；要求吏部司官，把一切官員之姓名籍貫，編造成冊，同時在下邊註明賢否，以便按圖索驥，使人才一求便得，以免所用非人。當然，給出評價的官員，要為自己的評價負責，一旦所用非人，要遭到懲罰等等……

會議還未結束，便已是哀聲四起……吏部乃是六部之中最有權力，也是最有油水的部門，許多吏部官員，都是仗著手中的人事權力，向其他官員市恩，甚至大撈好處。可要按照高拱這一套搞起來的話，那就要比都察院還得罪人了。一想起要和那個四處結怨的清水衙門看齊，一眾官員心說，那大家還混不混了？

於是有一個郎中，裝著膽子問道：“部堂，以前可沒有這些規矩啊。”

高拱睥睨他一眼，道：“你是新來的吧？”

那郎中茫然道：“是，下官一直在省裡，去年才調來部中。”

“那就難怪了。”高拱伸出大手，拍拍他的肩膀道：“當年我還是侍郎的時候，便對你的前任說過一句話，現在你給我聽好了，我只說一遍。”

那郎中一副洗耳恭聽狀，便聽高拱沉聲道：“記住了，自我之後，便有了規矩！”

說完不管那瞠目結舌的郎中，大步走出了會堂。

工欲善其事，必先利其器。

而高拱手中的武器，就是決定官吏任免升降的吏部。所以在對其他衙門進行整頓前，他要先把本部的官員捋一遍。

起先，聽說他要對本部進行考察，官員們在擔憂之餘，也有幾分僥倖。心說，不過是新官上任三把火而已，難道你高鬍子能把我們全撤了，誰來給你幹活？

然而他們都低估了高拱的魄力。他畢竟在吏部多年，對部務知根知底，甚至很多吏員的品性，他也心中有數，是以僅僅用了一個月，便將吏部上下整理了一遍，將那些貪汙、庸碌、怯懦、苟且之輩，統統掃地出門，竟然佔了本部全員的三分之一。

而且對這些人的發落不是外調降職，而是一律就地撤職，有違法者移送法司。

這下子這些官員不幹了，大家本來就是混口飯吃，你怎麼砸人飯碗呢？於是他們聯合起來，以集體告假的形勢，要用空衙來對抗高拱，逼迫他撤銷決定，或者讓朝廷換個尚書……這些不開眼的傢伙搞不清形勢，還妄圖以法不責眾來對抗高拱的權威。

當時抱此念想的不在少數，到了他們約定空衙的那天，那些被罷黜的官員，一早便在衙門門口，阻攔想要進去的同事，對他們道：“我們已經被罷官，現在這樣做是為了讓你們倖免，若是這次屈從了高鬍子，日後他要再發落你們，可不要後悔這次沒站在我們這邊。”讓他們這麼一說，其餘的官員也不好強行進去，只能站在門外，等等看再說。

一直到了卯時中，衙門裡還是空無一人