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這個編制變化實際上與唐帝國的改革是完全一樣的，美國也將西南太平洋地區劃了出來，成立新的戰區。為了平衡海陸兩軍，西南太平洋戰區司令官不是由海軍將領出任，而是由一名陸軍將領，也就是美國駐澳軍團總司令麥克阿瑟上將出任。

麥克阿瑟一直就是美軍駐澳軍團的總司令，在美國參戰的時候，他與尼米茲各提出了一套進攻方案。他提出的方案是從澳洲出發，進軍南洋地區，從南部威脅到唐帝國的本土。這個計劃後來被否決了，因為當時美軍在澳洲兵力連防禦都嫌少，哪有力量去掃蕩南洋地區？而且，這樣的作戰計劃必然要調動大批海軍艦隊，而美軍在澳洲的港口設施是不足以支援整個太平洋艦隊的。更重要的是，唐軍已經鞏固了南洋地區的防禦，而美軍主要部署在澳洲的東南部地區，在澳洲北部地區的軍事基地少得可憐，能夠部署轟炸機的機場更是少得可憐，要想發動進攻南洋地戰役行動。就至少需要數千架轟炸機的支援，不說這些轟炸機的調動是個嚴峻的考驗，就算調到了澳洲大陸去，恐怕也難以派上戰場。

因為自己的提議遭到否決，麥克阿瑟曾一度向上反應，甚至鬧到了總統那裡，希望能夠改變作戰計劃，將重點放到西南太平洋上來來。讓陸軍打上主力。結果還是不了了之。在馬里亞納群島戰役失敗之後，麥克阿瑟更是四處活動，一方面指責尼米茲的指揮失誤，一方面推廣自己的作戰計劃，力吹進攻南洋的重要性。在麥克阿瑟地遊說下，美國陸軍總參謀長（美國陸軍沒有總司令，只有總參謀長）馬歇爾上將，以及美國海軍總司令金上將最後做出了讓步，決定加強西南太平洋的部署，逐步將重點轉移到西南太平洋戰場上。如果唐軍不在西南太平洋上進攻的話。那麼就要儘量爭取向南洋地區挺進。當然，這只是個計劃而已，在沒有足夠的制海權保障的情況下。美國軍隊要想跨過大海，進攻南洋地區，這幾乎是不可能的事情。

實際上，尼米茲在馬里亞納群島戰役中的指揮並沒有什麼大的錯誤，而且其委任的幾位艦隊司令官都在作戰行動中完成了任務，哈爾西，斯普魯恩斯都重創了唐帝國海軍，挽回了局面。美軍失敗的原因是實力不如對手。從這場戰役雙方地投入，損失等各方面來看，美軍明顯處於下風。能夠在數十萬唐軍的重壓之下頂住半年，這已經是個了不起的奇蹟了。因此，尼米茲並沒有受到指責，沒有理由要他來承擔失敗的責任。但是有一點是無法迴避地，麥克阿瑟的指責必須要有人來做出答覆，結果就是將太平洋戰區一分為二，尼米茲負責處西南太平洋戰區之外的其他的區的作戰行動，而西南太平洋戰區則由麥克阿瑟擔任最高指揮官。

隨著戰區制度的改變，美國海軍太平洋艦隊的編制也出現了變化。在沒有足夠戰艦的情況下。美國海軍採用了一套全新的編制體系，即艦隊的指揮體系基本不變，但戰艦在不同戰區執行作戰任務，就分配到不同的艦隊去。

變革之後地美國太平洋艦隊分成了兩支主力艦隊，其中在尼米茲指揮下的為第五艦隊，由原太平洋艦隊司令部改組為第五艦隊司令部。在麥克阿瑟指揮下的為第三艦隊，由部分原太平洋艦隊的參謀軍官，以及一些從大西洋艦隊調來的參謀軍官組建艦隊司令部。也就是說，第五艦隊負責太平洋戰區內的作戰行動，而第三艦隊則負責西南太平洋戰區內的作戰行動。而這套體制後來還擴大到了整個美國海軍，編號為單數的為太平洋方向上的艦隊，而編號為雙數地則為大西洋方向上的艦隊。

實際上，美國海軍艦隊的編制體系與唐帝國海軍的艦隊編制有異曲同工之妙。唐帝國海軍沒有嚴格規定艦隊的番號，但特混艦隊在不同的戰區接受不同的戰區司令部的指揮。這樣，艦隊的完整性基本上得到了保證，因此指揮艦隊作戰的都是一套班子，不存在臨時換人，以及指揮官來熟悉艦隊的情況，這能夠提高艦隊在殘酷戰鬥中的戰鬥力。相反，美國海軍則重點保證了戰艦官兵編制的完整性，艦隊指揮班子則將在不同的戰區內更換，這實際上是保證了戰艦的作戰連續性，一艘戰艦可以在幾個戰區內奔波，持續作戰。實際上，這都是由兩國不同的情況所決定的，唐帝國擁有戰艦上的優勢，更重視在重要海戰中的表