石達開雖然兵臨桂林城下，但他仍然打算西進。他的一支部隊已經過了桂林西南部的義寧，挺進貴州邊界的思州，苗族民眾起來響應。湘軍再次提出攻打思州。

灌陽的太平軍也挺進到桂林以北的靈川，紮下一排排軍營，打算向西推進。

這支太平軍聽說湖南的援軍到來，便在大榕江的東西兩岸擺開陣勢，阻擊追兵。蕭啟江揮軍發起攻擊，太平軍無心戀戰，剛交手就主動撤退。蔣益澧的部將蕭榮芳也從柳州趕來增援，與蕭啟江的部隊在省城會師。

9月24日，蕭啟江率部到達桂林，劉長佑率部到達全州。

石達開率部從義寧前往柳州，打算與城內的起義軍聯合，但起義軍關閉城門，將他拒之城外。

9月29日，蕭啟江率部在桂林南門文昌閣打敗太平軍。蔣益澧的水師和陸師一起攻擊，再獲大勝。

10月5日，太平軍撤銷包圍，全部奔向義寧。

10月15日，太平軍攻佔柳州以西約一百五十里的慶遠，向南丹推進。另一支太平軍從廣西東部的富川進入廣東連山廳境內，被廣東清軍擊敗，殘部進入湖南。

與此同時，陳士傑和黃淳熙在湖南藍山擊潰起義軍。張運蘭率部出境作戰，殲滅廣東連州的起義軍。

曹澍鍾因防守桂林有功，奉調四川，祥奎繼任廣西巡撫，還未上任，曹澍鍾便上奏，請求留下蕭啟江防守廣西的西北部，而令蔣益澧向南進軍荔浦，以防守柳州。

蕭啟江一時成為搶手的人物。增援安徽的湘軍也急迫地上奏，請調蕭啟江。文宗下詔，任命劉長佑為廣西按察使，指揮廣西的湘軍。劉長佑率領八千人，從桂林西南方一百里處的永福向西南推進。太平軍在柳州西北面約一百里的柳城外面修築柵欄，向西連線羅城與天河，向南延伸到慶遠，分兵奔向柳州，又向東攻打藤州與昭平，橫亙廣西中部四百里。

駱秉章見清廷未把蕭啟江留在廣西，趕緊上奏，請派蕭啟江等部增援安徽。蕭啟江率部向北行進。劉長佑則率部南下，攻打柳州。

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陳玉成於8月份再次組織對來安的圍攻，李世忠率部夜襲，將太平軍擊退，將米糧和器械運到滁州城內。朱元興等部攻破沙河集與龍停口的太平軍營壘，滁州解圍。勝保仍然在盱眙抵抗太平軍的進攻，捻軍趁勢攻克定遠。

張國樑受命統領江北江南兩路清軍以後，深感責任重大。他派李若珠部攻打六合，派張玉良部攻打安徽天長，戰績不俗。

清軍南岸水師在安徽作戰，吳美全部攻打瀂港和鴉山，李德麟部攻打大通和荻港，也屢次獲勝。江南清軍派出援軍四處作戰，大營的地盤更加拓寬。

勝保的部隊在9月份終於挫敗了太平軍對盱眙的攻勢，多隆阿和鮑超的部隊則攻克了安慶西南八十里處的石牌。太平軍在石牌修建了一個大城壘，與西邊七十里處的太湖互為犄角。湘軍攻城時，安慶和潛山的太平軍趕來增援。多隆阿率騎兵攔截，將兩路援軍擊退。

清廷起用袁甲三為漕運總督，駐防蔣壩。勝保將大營轉移到五河。勝保剛走，太平軍就相繼攻佔江蘇的江浦、六合、天長和盱眙，而捻軍又佔據了安徽的鳳陽和臨淮。勝保由於母親去世，回鄉辦理喪事，他的官職由袁甲三繼任。

安徽捻軍出兵河南歸德，從蘭儀渡河攻打定陶和東明，返回潁州。清軍的將帥們都以起義軍回到根據地為幸事，為此而歡欣告捷。從這時開始，清軍寧願起義軍把根據地建在一省的腹地，直屬行省都引以為例。。　最好的txt下載網

1859年，咸豐九年（11）

胡林翼見湘軍已將太平軍趕出江西和湖南境外，便開始治軍儲餉，以掃平太平軍為己任。他見太平軍和捻軍在安徽勢力大為增強，將威脅到湖北，便改變初衷，提議把曾國藩留下，一起謀劃安徽戰事。他和官文上奏說，安徽形勢緊急，湘軍不宜西征。他們還提出兵分三路，各路一萬人：都興阿和楊載福沿江攻打安慶，曾國藩從太湖出兵攻打桐城，胡林翼率部從英山向舒城和六安推進。

新任安徽欽差大臣袁甲三為了自保，對湘軍的攻擊路線提出了不同的看法。他剛剛到任，便下令對捻軍開戰，苗沛霖率團練部隊會同清軍攻克臨淮。

袁甲三身在臨淮，聽說湖北那邊調兵遣將，以為湘軍已大舉進兵安徽，而安徽清軍兵力單薄，他擔心太平軍被湘軍擠到北邊，對他構成威脅。他提出曾國藩最好從光山和固始向北，繞過蒙城，進入安徽，遏止太平軍北上。

袁甲三