龍潭虎穴，就連地球上最強的中國也攻不進去，更何況是凱恩？凱恩並不想毀滅地球，因為他已經把地球看成返回家鄉的根據地，是他的兵源地。如果全被外星人佔領，那他也就掛了。

按照原本的劇情，本應該是GDI發動反擊，此時凱恩突然出現，整合澳大利亞的Nod部隊，然後前往歐洲拯救外星巨塔，因為那時外星人已處於劣勢。但現在沒必要了，巨塔是完成了，可思金人也不走了！什麼整合Nod部隊已經完全沒有必要！

這一年間，凱恩心灰意冷，只好靜觀其變，寄希望於中國能夠抵擋該死的思金人。果然，GDI毀了，現在只能躲在南非瑟瑟發抖，Nod四分五裂，東歐的地盤與部隊毀於一旦，現在南美也即將淪陷，但中國挺住了，不但挺住，還有餘力發動反擊，雖然沒有取得預計的結果，沒法攻破思金防護罩，但展現了實力——只要中國大軍集結的地方，思金人就沒法攻破！另外，中國人還開拓了海洋空間，已經為人類留下了退路。現在中國的七億人口中，已有一億人進入海底生活，看起來海底比陸地上更能賺錢。

現在眼看南美就要淪陷，凱恩急急忙忙鑽出秘密基地，乘坐一架特殊的運輸機離開了。他並不擔心這架運輸機會被思金人或者中國人擊落，因為採用了他家鄉的技術，防禦很強悍。他要前往澳大利亞，把Nod部隊整合起來。現在Nod人們已經差不多忘了凱恩了，在人們眼中，凱恩已在一年前“死去”，現在的掌權人是基蓮·卡達，但基蓮只能勉強掌管澳洲的Nod部隊，南美之類的地方號令不動，而今南美也即將淪陷。對凱恩來說，既然地球還有希望，那麼他就應該重新掌握權力，好在澳洲還有兩個人忠於他：指揮官凱撒和修士長愛麗莎。

南美淪陷了，從哥倫比亞到亞馬遜，到處都是肆虐的思金人，而鯤鵬基地對內陸軍隊鞭長莫及，基地的艦載機——鳳凰飛船又奈何不了數以億計的思金部隊，而南美又沒有數百萬的中國大軍，只好眼睜睜地看著南美淪陷，數億人慘遭屠戮，只有巴西沿海的人們來得及躲入海底，躲入中國的庇護之下（實際上這也有冷眼旁觀的意思，中國不希望全球還是外國人佔數量優勢）。最後，偌大的南美，逃到海底城市的難民只剩五千餘萬，這已經比北美的GDI好多了，畢竟近水樓臺。於是，劉雲再次擴建了南美沿岸的海底城市，以容納這批難民，很快他們就會變成中國公民，屬於新駙公民，好歹也擁有中國公民的基本權利了。

2048年8月，南美全境落入思金人掌控之中，他們在南美土地上建立了四個巢穴和四個巨型防護罩，在上面紮下了根。整個南美，除了沿海地區暴露在中國的炮火之下，思金人不敢進駐之外，其餘地方都是他們的地盤。那些沿海地區理論上還可以住人，但誰也不敢在那裡住下，天知道什麼時候思金人會打過來，還是進入海底城比較安全。而中國的海底基地，只能每天讓水面艦隊的鄭和級武庫艦對思金人炮擊一下，阻止他們進攻沿海而已。

此時，澳大利亞陷入也權力鬥爭之中。凱恩再次出現了，Nod同時擁有兩個領導人，這是不容許的，很快，那些忠實信徒立即追隨凱恩，與基蓮對立。好在澳大利亞的思金人並不多，澳洲人並未受到生命威脅，還有心思鬥來鬥去。至於GDI，已經沒落了，只有悉尼、墨爾本等大城市還有一些部隊，其餘的地盤都是Nod的天下。而澳洲西北部是中國軍事基地的範圍，沿海，南洋省的附近海域，海底之下也建造了不少海底城市，給中國南洋的百姓留下一條退路。

凱恩歸來，指揮官凱撒立即離開了基蓮，投入凱恩帳下，凱恩很是高興道：“指揮官，很高興看到你還能堅持信念，現在，我能依靠的只有你了！現在，我要追究一年前在薩拉熱窩發生的背叛Nod的醜行，所有背叛者都要付出血的代價！告訴我，當時是誰發動叛變，是誰圍攻大神宮的！”

“長官！我有一些資料要交給您！”此時，戰場情報官阿賈出現了，他帶來了當時的錄影證據。

凱恩神色凝重地看著這段影像資料，上面是一夥叛軍向大神宮喊話，話語內容多有涉及基蓮，處處表露出對他的不敬，對他的理念的懷疑，而這份證據，處處都指向基蓮！凱恩的神色陰晴不定，心裡浮起陣陣狐疑，不斷思考著那夥叛軍的目的：“他們真的是基蓮的部隊？他們這樣做，能得到什麼好處？事實證明，他們最後被指揮官消滅了，如果是基蓮做的，那麼對她沒有任何益處……不論如何，基蓮竟敢質疑我，還把澳大利亞經營得像鐵桶一樣，她接手Nod之後高層處處都是她的人！不管背叛者是不