方從哲這麼多年的首輔也不是白做的，他手底下自是有些自己人，紛紛出言為其辯解，說楊漣左光斗所述之事，除了賞賜李可灼是真，其餘全部是子虛烏有，是他們妄想借機排除異己，打壓朝臣，奏請皇上嚴懲。

隨後東林黨人士又開始反攻對方的言論，指責方從哲收受賄賂，在移宮一案上態度遲疑，一併指責力挺方從哲之人。

此時方從哲的支援力量雖未崩潰瓦解，但在東林黨的來勢洶洶之下，他們已漸漸不支，在方從哲本人都覺得這次要完了的時候，和東林黨不合的其他黨派紛紛站出來力挺他，朝堂上爭吵的雙方又漸漸相抗衡起來。

所謂敵人的敵人就是朋友，看到孫慎行、惠世楊、楊漣等人慾置方從哲與死地，齊楚浙三黨的官員開始出招了。

自從萬曆二十一年的癸巳京察開始，東林就開始利用京察清洗異己，後來東林黨人士吏部侍郎楊時喬主持京察時對浙黨有所打擊，引起浙黨的憤恨，浙黨領袖人物沈一貫上書給萬曆反擊他們，雙方爭鬥多年各有損益，黨爭一事依舊沒有結束的傾向。

除了楚黨之外，還有一些其它派系，比如以官應震、吳亮嗣等為首的楚黨，以山東籍官僚為主的齊黨，當然，其它小派系或者無派系的官員也有不少，齊楚浙三黨眼見東林黨的聲勢逐漸壯大起來，心中很是憂慮，但以一己之力又難以與其相抗衡，於是安穩起見，他們開始聯起手來，到萬曆四十五年，結盟達到鼎盛的三黨決定徹底清洗東林之人，在他們的團結攻擊之下，東林黨幾乎被從朝中一掃而空。

然而官途就是這麼起起伏伏，之後就是東林黨重新崛起，開始了反攻敵手之路，刑部郎中於玉立派遣他曾經救助的獄吏汪文言進京，企圖使用離間計徹底摧損齊楚浙三黨的結盟，讓他們自相殘殺，一舉殲滅了這些人，之後就屬東林獨大了。

于玉立的注意是好，汪文言的腦子是靈，原本他們的計謀是會成功的，怎料到汪文言這個倒黴小子到了京師居然投到了王安門下，計劃還沒進行就很不好運的遇到了喬婉，就這樣被喬婉用計拐到侯府做起了管家，與于玉立分道揚鑣。

這麼一來，東林黨的離間計就此夭折，使得齊楚浙三黨得以避免終結的命運，其它的一些小黨小派也就更安全了。

朱由校漸漸長大，心智謀略逐步成熟，開始意識到黨派之爭的嚴重性，那他就不可能不插手此事，是以，現在的情況是東林黨漸漸坐大，而齊楚浙三黨又慢慢凝聚在一起，至於其他官員，有做牆頭草的，也有不參與黨爭的。

很多情況下，結黨與營私這兩個詞會相繼出現，結黨並不只為營私，不少是因政見相同者為實現為國為民的抱負相互扶持，但不可否認，結黨之後終是避免不了營私。

沒有一位皇帝希望看到自己的臣子各自結黨，這會讓皇權架空，讓大臣們對於君主的依賴性減弱，更重要的是如果結黨嚴重的話，會對整個國家的統治大為不利。

朱由校的思想也不外如是，不管是做為即將要當皇帝的長孫殿下，還是現在已經登基為帝的他，都將此事看的很明白。

他不想看到朝臣結黨，他想領導一個眾志成城的朝堂班底一同開創大明盛事，不想看到那些沒事就相互攻擊盡會託他後腿的相爭黨派，但就是因為朱由校看的明白，他才知道這是不可能的，有人的地方就會有私心，有利益的地方就會有爭搶，朝政有意見不合之處就會有爭議，結黨是避免不了的。

況且朱由校也不希望自己手下全是應聲蟲，那樣就等於是閉目塞聽，當整個朝堂完全成了他的一言堂的時候，很可能就是他止步不前的時候，這是他怎麼樣都不想看到的情況，所以他的臣子結黨又是必須的。

看著下面爭得吵吵嚷嚷的眾臣，朱由校冷笑，既然避免不了，那就統統都為我所用好了，東林黨他需要，齊楚浙三黨同樣需要，那些無黨派人士更是必不可少，牆頭草也有牆頭草的妙用。

此外朱由校還有一個顧慮，也不得不為此好好地籌劃一番，那就是忠義幫和一品樓的眾人，朱由校用腳趾頭想都會知道，他們很快就會以不可思議的速度崛起，成為朝堂上不可抗拒的中流砥柱，呵呵，朱由校不會阻擋他們的崛起，他一手培養起來的人才和勢力他又怎會不多加以利用，且這也是他們這些有功之人應得的。

可功高震主的事不乏其例，居功自傲變得四處橫行之人更是不少，若是朝堂上到處都是這些人，事態將會一發不可收拾，為此，他又不得不防，他知道這些人現在都是好樣的，可人心易變，他不能保證在經過金錢