路向蕪湖、太平、秣陵關追擊；並以一部渡過長江迂迴浦口，對南京的包圍圈一天天縮小。

參加南京保衛戰的中國部隊為第七十二軍之88師、第七十八軍之36師、教導部隊、憲兵部隊，另外，自淞滬擔任掩護撤退的第七十四軍、第六十六軍、第八十三軍也先後奉令退回南京參加戰鬥。這三個軍老兵很少，新兵大都尚未受過訓練，戰鬥力較弱。5日拂曉，第六十六軍派在句容佔領前沿陣地的兩個團與日軍接觸，苦戰後方始突圍，損失很大。6日，日軍約一聯隊向湖熟鎮前沿陣地猛攻，第51師守軍抵抗後，始將湖熟鎮放棄。同時，由土橋鎮攻擊索墅鎮之日軍，復向淳化鎮陣地施行威力搜尋，大批日機整日在淳化鎮陣地輪番轟炸，守軍冒死抗戰。　7日，淳化鎮與東昌街間的湯水鎮前第一線陣地，為日軍騎兵突入，守軍被迫於入暮後撤退至第二線，固守湯山及湯水鎮。侵入淳化鎮之日軍以步、炮、飛機協同向守軍陣地猛攻，機槍掩體都被擊毀，守軍傷亡很多。至8日，日軍進攻淳化鎮愈烈，並分向東樵村西莊附近包圍，企圖截斷守軍歸路，第51師奮勇抵抗，死亡累累，其中五營官兵全部壯烈犧牲。由於後援未及時趕上，淳化鎮於下午4時失守。同日，日軍以主力及炮兵、機械化部隊進攻湯山守軍第二道防線，與守軍混戰至8時許。

12月9日，中國軍隊抗擊日軍紫金山防禦戰打響。11月底，南京守軍教導總隊奉命防守岔路口、紫金山、孝陵衛、中山門、太平門地區。12月9日拂曉，敵人集中兵力攻擊紫金山東麓老虎洞陣地。教導總隊第五團羅雨豐營利用構築好的陣地，以密集火力退敵。敵空軍投擲大量炸彈，炮兵不斷轟擊，步兵連續衝鋒。下午，守軍犧牲過半，營長羅雨豐壯烈殉國，守軍不得不向紫金山第二峰後撤。

12月9日，教導總隊與日軍激戰光華門。拂曉，日軍進至光華門外，佔領大校場及通光營房。守衛光華門的教導總隊第二團第一營官兵立即緊閉城門，壘起沙袋。日軍用野山炮將光華門打穿，泥沙外瀉，有少數日軍從泥沙上爬入，很快被守軍殲滅。10日上午，中國守軍第八十三軍156師增援光華門及通濟門。敢死隊用繩索從城牆上吊下，用機槍和手榴彈把進入城門洞的敵人消滅。城外守軍第七十一軍87師259旅和261旅奉命從黃昏開始進攻光華門之敵軍，奮戰幾小時，退敵進攻。旅長易安華、旅參謀主任倪國鼎等30餘名官兵為國捐軀。當晚，光華門城垣守軍以大量手榴彈痛擊第二次入城敵人。夜，守軍謝承瑞團長將開口的汽油桶從城牆上丟到城門洞口，投下火種，火燒敵人。11日拂曉，謝團長派一排戰士，用十幾挺輕機槍同時掃射，全殲隱蔽在外廓城門洞內之敵，光華門、通濟門轉危為安。

12月11日，日軍的進攻重點轉向中華門外的雨花臺。負責防守雨花臺的是右翼陣地88師262旅和左翼陣地88師264旅。從12月9日到11日，雨花臺陣地不斷受到日軍的進攻。262旅和264旅憑藉地形殊死抵抗，寸土未失。日寇的進攻在11日達到最激烈的程度。雨花臺守軍的傷亡越來越大。262旅旅長朱赤少將和264旅旅長高致嵩少將手中，再也沒有一兵一卒可供投入戰鬥，而且他們沒有任何援軍。戰鬥進行到12日凌晨，傷亡慘重的守軍依然牢牢控制著雨花臺。日軍暫停了進攻，調集重炮和飛機轟炸262旅陣地。炮聲停止後，蜂擁而上的日軍步兵再也沒遇到抵抗。守軍262旅全軍覆沒，旅長朱赤少將殉國。此時，雨花臺右翼264旅的堅守更加艱難。日軍在炮火的支援下已衝上陣地，與守軍短兵相接。混戰持續到下午。264旅陣地失守，旅長高致嵩少將陣亡。雨花臺失守，日軍取得了制高點，繼續向中華門進攻。至12日，守軍74軍51師302團團長程智殉國。但中華門守軍依然死戰不退。

在大多數部隊潰退之時，紫金山教導總隊陣地依然戰鬥激烈，光華門上第二團仍然在竭力反擊。當撤退令下達到第二團時已是13日凌晨。教導總隊立即奉命轉移。傷病交加的謝承瑞團長就在此時犧牲在陣地上。10日至11日，敵人向紫金山第二峰、陵園新村、孝陵衛西山主陣地發起猛攻。敵空軍也常來轟炸助戰，坦克、步兵一齊出動，戰場硝煙瀰漫，槍炮聲震撼山谷，雙方傷亡都很大。鏖戰至12日下午6時，第二峰西山陣地被敵攻佔；防守陵園新村的第三團退守天堡城、明孝陵東側高地。總隊長桂永清、參謀長邱清泉擅離總隊部，致使紫金山落入敵手。

12日守軍撤退，南京城沒有被日軍攻破，城外一半以上的地區還控制在國軍手中。中華門方向沒