他的助手到“軍技室”後，受到溫毓慶的排擠也就在情理之中了，被安排在第一組做外交密電的研究工作。此時的日本外交密電的翻譯工作已經總結出一套操作規程，一般懂得日文的人都可以操作，根本沒有必要把池步洲等人拴在這裡打發日常事務，而應該發揮他們的最佳效用去破譯更加有用的日本陸軍密電碼。第一組的組長是霍實子，霍實子是早期的留日學生，在交通部電政司時曾協助溫毓慶研究破譯日文密電，而且已經取得了一些成就。霍實子與池步洲並無工作和私人關係上的恩怨，只是他帶來的幾個報務員在好長的一段時間裡都沒有截獲到任何日本密電，使得池步洲等人根本就沒有什麼東西可研究，為此池步洲想退出“軍事委員會技術研究室”另找門庭。霍實子瞭解了此事後，要溫毓慶出面做池步洲的工作。

在“軍事委員會技術研究室”組建前，溫毓慶就知道了池步洲的名字，也知道他所取得的成就，但從來沒有見過面。當他得知內情後特地讓霍實子安排與池步洲見了面。據池步洲後來對人說，這次見面溫毓慶的風度和涵養給他留下了非常好的印象。而溫毓慶在與池步洲見面時，對池步洲到“軍事委員會技術研究室”後上交的關於日本外務省外交密電密碼本的編排方法讚不絕口，幾次說：“你們破譯的密電碼不但層次高，而且速度快，真是難得！”溫毓慶說的這話是否出自內心也只有他本人清楚，但他的用意是非常明確的，那就是希望池步洲打消另外的念頭。而池步洲雖然當著溫毓慶的面對自己的去向沒有表態，但他對溫毓慶說的那些話還是聽進去的，後來他沒有離開“軍事委員會技術研究室”就是個證明。池步洲與溫毓慶的見面是第一次，也是最後一次，因為沒過多久溫毓慶到香港治病後就再也沒有回來過。

池步洲並不清楚，溫毓慶的悄然離去與魏大銘任代主任之間的內在原因，他只是覺得溫毓慶就這樣走了有些不明不白，甚至對溫毓慶的走有些惋惜。這些池步洲與人說了，而且次數還不少。於是，有人很快把這話傳到了魏大銘那裡。魏大銘完全明白池步洲在破譯日本密電碼方面的能力和已經有的成績，為此他對池步洲採取的是敬而遠之的孤立政策，就是他在任副主任的日子裡也少有與池步洲接觸。可當魏大銘聽說了池步洲對溫毓慶離走的那些話後坐不住了，他知道池步洲這樣的話多了對自己掌控全域性不利。為此，魏大銘派隨從副官把池步洲叫到辦公室裡談話，他想透過談話摸清池步洲的心事。當池步洲走進魏大銘的辦公室時，見魏大銘緊繃著臉一副傲不為禮的樣子，頓時心裡有了不舒服的感覺。池步洲此時的感覺是，魏大銘與溫毓慶不是同一種人。見魏大銘好久沒有叫座，池步洲隨手拉過張椅子坐了下來。他望著椅子前的地面既不點頭也不開口，這不冷不熱的場面使魏大銘尷尬了好一陣子。過後，不管魏大銘說什麼，池步洲除了點頭很少回話。魏大銘自感無趣，只得早早地結束了這次談話。巧的是池步洲與魏大銘見面也只有這一次，沒有過多長時間被“軍事委員會技術研究室”的同仁們趕走了。

原來魏大銘代理“軍事委員會技術研究室”主任後，就按照戴笠的意思，一心要把“軍事委員會技術研究室”控制在軍統局的人員手中。他首先下令，要全室人員各交二寸半身照片三張，企圖把所有人員強行拉入軍統組織。可魏大銘沒有料到，這事遭到了“軍事委員會技術研究室”很多人的反對，特別是原來跟隨溫毓慶工作的那些人更為激烈。戴笠聽說後，他親自出面請客吃飯，進行多方面的拉攏，但也沒能奏效。魏大銘見軟的不行就採用了硬的手法，他指使秘書室人事股從人事檔案中，把溫毓慶的親信時任秘書室秘書的王維均等三人的照片取出，隨函送到重慶衛戍部稽查處，以這三人有“通敵嫌疑”為由，要求稽查處派人監視。稽查處隨後覆函說：“本處人手不足，無力承擔此項任務，若確有必要，可由貴室自派軍統人員就近監視。”這封覆函發到“軍事委員會技術研究室”後，湊巧被王維均本人拆閱時發現。過後，王維均等人聯名寫報告給蔣介石控告魏大銘，並附上了重慶衛戍部稽查處的函件。此時的蔣介石對“軍事委員會技術研究室”內部的矛盾已有所瞭解，在權衡利弊後，即下令撤了魏大銘在“軍事委員會技術研究室”的任職，要戴笠將其調回軍統局。魏大銘走後，蔣介石又命毛慶祥為“軍事委員會技術研究室”的代主任。毛慶祥上臺後，留下來的軍統局的人員又處處為難他。於是，毛慶祥再次向蔣介石告狀，迫使蔣介石下令在“軍事委員會技術研究室”的所有軍統人員全部退回軍統局。自此，“軍事委員會技術研究室”的一切活動，都與軍統