又是共產黨公佈的43名戰犯之一，但他屬於被蔣介石一貫打壓的元老派系。蔣介石欲冠冕堂皇抬出孫中山的靈位時，又不得不裝模作樣地禮待孫科一番。這一點，宋慶齡看得非常清楚。當然，她作為孫科名義上的繼母，年齡與孫科相差無幾，兩人的關係亦很微妙。從現時解密的檔案資料看，他們表面上沒什麼大的衝突，也無過多私人交往。惟一一次共同公開亮相的照片，是一起為孫中山守靈。

但孫科對宋慶齡繼母身分的認同，最初是帶有牴觸情緒的，據傳孫中山欲與宋慶齡成婚時，曾受到國民黨上層元老的極力反對。內以胡漢民、朱執信為甚。這兩人喋喋不休勸誡孫中山時，孫中山曾斬釘截鐵地答曰：“這是我的私事，請黨內同志不要橫加阻撓。”這兩人又請孫科以父子情分相勸。孫中山給遠在美國的孫科寫了封長信，解釋這段婚姻的來龍去脈。

此時，已深沐西洋之風的孫科沒有說什麼。歸國後，他到澳門安頓了母親盧太夫人，便到廣州參與國民黨的政事。在那裡，他首次見到了宋慶齡。由於孫科特別敬畏父親孫中山，即使他心中有所不快，亦不敢表露出來。從大面子上講，兩人維繫了普通禮儀並無衝突。後來，孫科兒女成行，在公開場合，他的子女仍尊稱宋慶齡祖母。

不過，自從1929年孫中山的奉安大典舉行後，他們沒有在公開場合一起露過面，平時往來也不多。據說，宋慶齡對蔣介石數度想謀殺自己的事，一直沒作公開回應。即使解放後，批倒批臭“人民公敵蔣介石”，宋慶齡也未發表過什麼指斥的言論，更別說憤怒聲討對方的惡劣行徑。可以肯定的是，宋慶齡透過一些渠道，獲知了孫科曾專門打電話給蔣介石，勸說對方一定要保證自己的安全。

宋慶齡對此頗為感動。

大約在1949年9月的一天，廣州解放在即。宋慶齡已獲知孫科無意去臺，而是滯留香港。於是，宋慶齡撥通了孫科的電話。

“哲生嗎？”

“你是……”正忙於逃離廣州的孫科抓過電話，不待對方反應，便驚呼了起來，“啊……夫人。您在哪裡？安全嗎？”

“我在哪裡你先別管。安全上絕對沒問題。”

“那……”孫科驚異之下，問道，“夫人有什麼賜教？”

“你不要走。”宋慶齡在電話那端勸道，“留在大陸吧。”

“可我是共產黨所列43名戰犯之一。”孫科猶豫著說，“覆巢之下，安有完卵。以他們的階級成分而論，我留在大陸，還不是革命的物件？”

“你不要顧慮那麼多。”宋慶齡苦口婆心勸道，“你沒有領兵打仗，沒有殺人放火，也沒有參與蔣介石的重大決策。共產黨這邊也是清楚的。我勸你留下，不要到處亂走。這樣會有好處。”

孫科陷入了短暫的沉默。

宋慶齡握住話筒，焦急不已，“哲生，你在聽嗎？聽清了我的話沒有？”

“夫人，”孫科扶扶眼鏡，抹了抹汗涔涔的臉，頹然嘆道，“哲生誤入宦海太深，早已回頭無岸。請夫人善自珍攝。”

宋慶齡知其去意已決，只得怏怏放下了電話。後來，孫科去了香港，滯留了兩年，後轉道歐洲，再赴美國。飄零十三年後，蔣介石又要借用他“國父哲嗣”的名號，惺惺作態中，這才邀請孫科去臺，給了他有職無權的考試院院長一職。

就在宋慶齡挽留孫科的當晚，一向筆走龍蛇的毛澤東以工整的筆法，恭恭敬敬地給宋慶齡寫了一封信：“重慶違教，忽近四年，仰望之誠，與日俱積。茲者全國革命勝利在即，建設大計，亟待商籌，特派鄧穎超同志趨前致候，專程歡迎先生北上。敬希命駕蒞平，以便就近請教，至祈勿卻為盼。”

一位老學究感嘆：新朝“天子”敬重“前朝太后”，史無前例。

軍統特務李志桐也來了興趣，便蹲下身，用樹杈在地上隨手劃了個“笑”字。那老兵圍著字一看，又打量了李志桐一番，略一沉吟，便拆解道：“這個字表面上看大吉，實則不吉利。”綏遠來了個不速之客。曾被蔣介石寄予厚望的主帥董其武在宴會上說：“你們的槍還沒摸出，早成了馬蜂窩。”

令蔣介石切齒痛恨的民盟幾個首腦人物，如張瀾、羅隆基、史良、章伯鈞安然脫險後，蔣介石大為震怒，卻又不得不接受這些人衝出樊籬的現實。

此時，共產黨已解放東北、華北，據有古都北平，正緊鑼密鼓地籌備開國大典，與民盟和各界人士一道商討召開政治協商會議。聞知這一切，蔣介石如就湯鑊，當他擰開收音機，讀罷各類電報函件後，