957年10月劉志堅為副主任。根據中央軍委1956年底做出的裁減軍隊數量，提高質量的決定精神，1957至1958年，中央軍委先後撤銷了總幹部部（即總幹部管理部）、武裝力量監察部等部門，將幹部工作和政治監察工作劃歸總政治部，青年部和組織部合併，文化部和宣傳部合併，經過整編調整後，總政治部的下轄機構為9個部門：組織部、幹部部、宣傳部、保衛部、聯絡部、群眾工作部和軍事檢察院、軍事法院以及秘書長系統。

1960年，林彪主持召開的軍委擴大會議，錯誤地批判總政治部主任譚政，1961年1月，譚政被撤銷總政治部主任職務，羅榮桓復任總政治部主任，蕭華、譚政、劉志堅、徐立清、梁必業、甘泗淇、傅鍾為副主任。1962年，總政治部整編，將青年部從組織部分出。將文化部從宣傳部分出，並增設國防科學工作部和直工部、管理局。1963年12月，總政治部主任羅榮桓逝世。1964年9月，蕭華任總政治部主任。1966年6月15日，任命袁子欽為副主任。1966年6月23日，林彪以莫須有的罪名撤了總政治部副主任梁必業的職。

“文化大革命”中，總政治部受到嚴重破壞。林彪、江青反革命集團出於篡軍、反黨奪權的陰謀需要，以種種罪名打倒了總政主任蕭華和副主任劉志堅、徐立清、傅鍾、袁子欽等，1967年6月，劉西元任副主任。同年7月25日，林彪和江青一夥提出“徹底砸爛總政閻王殿”後，總政治部主任、副主任等領導幹部都被關押、批鬥和審查，總政治部機關陷於癱瘓。11月，軍委辦事組政工組，取代了總政治部領導。1968年10月，對總政治部實行軍事管制。1969年10月，開始重新組建總政治部。10月10日，黃志勇、田維新任總政治部副主任。12月，總政治部恢復辦公，李德生任總政治部主任。總政治部機構設組織部、幹部部、宣傳部、保衛部、群工部和辦公室，幹部人數不到200人，任務是負責公文的承辦批轉工作，從而大大降低了總政治部的領導地位，削弱了其領導職能，使全軍的政治工作受到嚴重損害。粉碎林彪反革命集團後，1972年7月，與林彪事件有牽連的總政治部副主任黃志勇被隔離審查。1973年12月22日，中央軍委釋出8大軍區司令員對調的命令，總政治部主任兼北京軍區司令員李德生被調任瀋陽軍區司令員。1974年1月14日，魏伯亭任總政治部副主任。12月20日，梁必業任副主任。1975年1月5日，張春橋任總政治部主任，副主任為梁必業、田維新、魏伯亭。同年6～7月，葉劍英、鄧小平主持召開軍委擴大會議，確定以“軍隊整頓”、“要準備打仗”作為一個時期的中心工作。根據會議的精神，對總政治部領導班子進行了調整。8月30日，任命徐立清、黃玉昆為總政治部副主任，同時魏伯亭調任成都軍區副政委。總政治部的機構作了調整，將宣傳部分編為宣傳部和文化部，將群眾工作部分編為群眾工作部和聯絡部，機關編制人數也有了增加。但由於江青反革命集團的干擾破壞，總政治部的職能和作用仍沒有得到恢復。

1976年10月6日，張春橋系江青反革命集團主要成員，中共中央政治局對張春橋實行隔離審查。1977年8月29日，韋國清任總政治部主任，梁必業、徐立清、傅鍾、黃玉昆任副主任。9月21日，增補顏金生為副主任。同年，總政治部增設了中國人民解放軍軍事法院和軍事檢察院。1978年10月5日，增補朱雲謙為副主任。中共十一屆三中全會以後，總政治部得到了恢復和發展。總政治部根據中央軍委的決定調整了機構：設組織部、幹部部、宣傳部、文化部、保衛部、聯絡部、群工部、軍事檢察院、軍事法院和辦公廳、直政部、管理局。1980年1月11日，中央軍委任命韋國清為總政治部主任，梁必業、甘渭漢、傅鍾、黃玉昆、顏金生、朱雲謙、史進前、華楠為總政治部副主任。同時徐立清調任成都軍區政委。1982年，總政治部的機構又作了精簡，總政領導班子再次進行調整，總政辦公廳改為總政辦公室。1982年9月，餘秋裡任總政治部主任，免去韋國清總政治部主任職務。同年12月任命甘渭漢、黃玉昆、顏金生、朱雲謙、華楠為總政治部副主任，免去梁必業、史進前副主任職務。1985年，將總政管理局和直政部合併為直工部，總政辦公室改為總政辦公廳。3月9日，總政治部領導班子又一次進行調整，餘秋裡任主任，周克玉、朱雲謙，周文元為副主任，免去甘渭漢、顏金生、華楠副主任職務。顏金生後任軍委紀律檢查委員會副書記。同