1939年1月6日，周保中在柳樹河子主持召開了中共吉東省委臨時會議，著重處理了第5軍第1師師長關書範動搖叛變問題，穩定了部隊情緒，堅定了克服困難抗戰到底的信心。隨後，接連打了幾次勝仗，部隊也受到很大損失。3月，日偽軍約6000人，編成10餘支“討伐隊”，對第2路軍留守部隊輪番進行圍攻。第2路軍處境十分困難。中共吉東省委擴大會議決定，留少數部隊在刁翎地區鉗制敵人，主力分路向外線轉移。4月初，第2路軍總部和第4軍留守部隊開始向寶清、密山方向轉移。日軍步、騎兵約七八百入跟蹤追擊。周保中等指揮所部在葫蘆葳子（今海林具境內）組織還擊，斃傷日軍120餘人。爾後越過圖佳鐵路，於6月29日到達寶（清）密（山）附近的藍棒山臨時後方基地。柴世榮率領第5軍在向穆稜方向前進中被敵人發覺，遂於泉眼河設優，激戰5小時，共殲日偽軍約300人。5月初，第5軍部隊終於到達鏡泊湖一帶，與第1路軍的第3方面軍取得了聯絡，共同開展活動。在舒蘭活動的第10軍由軍長汪雅臣率領於6月化裝成偽軍，在小南門至九十五頂子山的途中，消滅日軍數十名。9月，又在亞布利消滅日偽“討伐隊”100餘名，繳獲一批武器彈藥。抗聯第8軍在臼偽軍頻繁的軍事“討伐”和政治誘降之下，到1938年冬各師相繼瓦解。

1939年3月19日，早已動搖的軍長謝文東率軍部部分人員叛變投敵。

隨後，副軍長騰松柏也投降了敵人，抗聯第8軍全部瓦解。

（三）抗聯第3、第6、第9、第11軍的主力部隊遠征

1937年底至1938年初，北滿抗聯部隊領導人——第3軍軍長趙尚志、第6軍軍長戴鴻濱、第11軍軍長祁致中越界進入蘇聯國境以後，日偽軍對松花江下游地區的進攻有增無減。抗聯各軍與眾多的圍攻之敵進行艱苦的奮戰和周旋，給予敵人以有力打擊，同時自己也受到嚴重損失。為了突破敵人包圍，扭轉這種被動局面，中共北滿臨時省委於1938年6月初作出決定：將第3軍由10個師縮編為4個師和1個警衛團；北滿抗聯各軍主力部隊立即分批穿越小興安嶺，向西部的海倫地區進行遠征，以開闢新的抗日遊擊區。7月，北滿抗聯總政治部主任張壽海Вɡ鍅作耄┰諑鼙甭榛�腫誘倏���剎炕嵋椋�怨岢故∥�賾謐櫓�髡�木齠ā�

參加這次向西遠證的有抗聯第3、第6、第9、第11軍主力部隊共700多人。在北滿臨時省委統一領導下，由張壽海А⒔鴆摺⑽撼た�⒎脛胃倬嚀遄櫓��秩���小５�9軍軍長李華堂因不同意遠征，帶領部分隊伍潛入深山躲避，後於1939年7月率部攜械投敵。

首批遠征部隊由第3軍政治保安師師長常有鈞、第9軍第2師師長郭鐵堅和第9軍政治部主任魏長魁率領所部共約150多人組成，已於6月出發。

部隊分別渡過鬆花江，在通河小古洞集結並籌集給養後，即向海倫方向前進。

途中遭敵襲擊，魏長魁犧牲。6月底，部隊到達慶城九道崗附近時，再次遭到敵人包圍。在突圍時，常有鈞和郭鐵堅失掉聯絡，遂率政保師及第9軍第2師第4團部分人員，於9月下旬到達海倫第3軍第6師後方，在後來的戰鬥中，常有鈞被叛徒殺害。郭鐵堅率領第9軍第2師第5團60多名戰士空圍後，繼續前進，由於作戰犧牲、飢餓、傷病，在11月到達海倫八道林子時只剩下20餘人。

第二批遠征的有兩支部隊：一支由第6軍參謀長馮治鋼、第2師師長張傳福率領的軍部教導隊和第之師第11團及第1師第6團共200餘人組成；另一支由第3軍政治部主任金策、第6軍第3師師長王明貴、第3軍第3師政治部主任侯啟剛率領的第3軍第3師和第6軍第3師第8團、第1軍第12團及第4師部分隊伍共300餘人組成。

第6軍遠征部隊於8月上旬從蘿北老等山出發，8月23日，在湯原黑金河西溝岔口遭敵襲擊，張傳福師長及7名戰士犧牲，給養和馬匹大部散夫。

當時正值雨季，陰雨連綿，風雨交加，戰士們穿著溼透的衣服，吃著野菜山果繼續前進。為了擺脫敵人的追擊和堵截，馮治綱率領部隊日夜兼程，過草甸，穿樹林，披荊斬棘越過小興安嶺。經過1個多月的艱苦行軍，終於到達海倫東部八道林子，與第3軍第6師師長張光迪所率部隊會合。

第3軍遠征部隊在金策等率領下於9月6日從蘿北出發，冒雨人沼澤地行軍，幾天之內就有10名戰士因飢寒患病而死，馬匹也因疾病接連死去。部隊進入湯原