第11軍當時由岡村寧次擔任軍長，其所屬及加強後的主要作戰兵力包括：第6師團，第101師團（缺飯壕支隊），第106師團，波田支隊，另配屬地炮、高炮、機槍大隊、通訊、野戰探照燈、架橋渡河等加強支援兵力。

擔任主攻的日第11軍作戰大致計劃區分3個階段，即第一階段打通安慶至九江一線的長江通道，為後續進攻和展開創造有利態勢；第2階段則佔領九江至德安的南潯鐵路沿線地區，並視情奪取南昌，以準備爾後向武漢地區發起的總攻擊；第三階段即是集中精銳，繼續沿長江兩岸前進，〃直接攻佔武漢地區的要地〃，最終完成本次戰役目標。上述三作戰階段環環相扣，各有側重，而尤以第2階段最為關鍵，其作戰結果直接影響整個作戰的成敗。

而由華北派遣軍轉隸華中派遣軍指揮的第2軍，再加上第13師團，擔任大別山麓方面輔助方向進攻任務，重在牽制中國軍隊，配合11軍的主攻任務。

第2軍所屬及加強後的主要作戰兵力包括：第10、第13、第16師團；另配屬地炮、高炮、機槍大隊、通訊、野戰探照燈、架橋渡河等加強支援兵力。

作為先期性作戰，日軍大本營要求，〃第2軍在擔任作戰境界內的江南地區和揚州以及津浦沿線地區的警備的同時，逐漸於6至7月將部隊集結於廬州附近，並伺機佔領六安、霍山等地，為沿大別山北麓遂行作戰作好準備。而第11軍則先期攻佔黃梅及九江等地，之後向瑞昌德安一線發展進攻。以一部溯揚子江而上，又沿其兩岸前進，直接攻佔武漢地區的要地。主力沿揚子江右岸前進，然後切斷粵漢鐵路，且儘量捕捉和消滅敵人〃。

日軍此次進攻十分強調空海軍力量的使用，總體要求，〃陸軍航空兵團和海軍航空部隊要緊密聯絡，以期消滅敵空軍力量，同時對敵國要地進行攻擊。陸軍航空兵團以配合地上作戰為主，海軍航空部隊以配合江上作戰為主〃。

空軍方面總的任務是，〃大致在影響地面作戰的地區內應投入飛機，摧毀敵空軍力量和攻擊敵要衝〃，明確要求〃航空兵團應以主力配合第11軍，以一部配合第2軍的作戰，同時抓住良機摧毀敵人空軍戰鬥力量，並攻擊要地〃，主要基地儘可能靠前部署。

具體安排是，作為此次作戰的主要空中支援兵力，德川（中將）陸軍航空兵團之第一飛行團（偵察一箇中隊（9架）、戰鬥兩個中隊（24架）、輕轟炸兩個中隊（18架））直接配屬第2軍；第4飛行團（戰鬥2至4箇中隊（24至48架）、重轟炸5至7箇中隊（30至40架）），主要在第11軍方面，時而把重點放在第2軍方面；第3飛行團（偵察3至4箇中隊（27至36架）、戰鬥一箇中隊（12架）、輕轟炸3箇中隊（27架）），全力協助第11軍（包括陸軍溯江部隊）。

海上航空兵作戰力量方面，日海軍第2聯合航空隊下轄第12航空隊（艦上戰鬥機兩個半隊（45架）、艦上攻擊機一個隊（18架））、第13航空隊（陸上攻擊機2個隊（48架）、艦上戰鬥機一個隊（18架））以及第15航空隊（艦上戰鬥機一個隊（18架）、艦上攻擊機半個隊（9架）、艦上轟擊機一個隊（18架））全力支援作戰，其主要任務是〃以消滅敵人航空兵力為第一義，經常、毫不松馳地壓制敵人。同時積極協助陸海軍溯江部隊，以最大努力攻擊敵要地，直接或間接協助和策應陸軍作戰〃。

海軍作戰兵力方面，日本大本營於6月18號，向其中國方面艦隊下達了準備攻佔漢口的〃大海令一二三號〃，命令指出，〃中國方面艦隊以第三艦隊進行揚子江的溯江作戰，在擊敗當面之敵的同時，佔領水路，協同陸軍攻佔武漢〃，第三艦隊區分為溯江部隊和鄱陽湖部隊，其主要任務是〃以其一部配合陸軍溯江部隊，儘快開啟揚子江水路順次到達上游，作好進擊漢口的準備。爾後以主力開啟揚子江水路，一舉攻到武漢前面將其攻佔。又，確保控制鄱陽湖內水域，配合陸軍部隊攻佔南昌〃。

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日本軍隊的作戰方案（2）

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此外，為保障作戰，日軍大本營還精心組織了大量的後勤支援部隊和補給基地，包括港口、鐵道、特種物資等，例如要求其〃江船隊隨著沿揚子江作戰的進展，應協助需要的兵團作戰。又，應擔任沿長江及鄱陽湖軍的補給運輸〃，〃第三鐵道隊仍繼續執行原任務，同時應爭取及時補修、利用所佔領的鐵道〃。

特別需要提及的是，日軍還還作好了實施毒氣戰的強化訓