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動畫工作室的內部培訓部門皮克斯大學也派上了用場。通常，這個部門提供一般的藝術和技術培訓課程，用來幫助員工提升技能和開闊眼界，該部門還負責管理公司的檔案。不過，有時候它也會在某部影片的製作中提供幫助。在《海底總動員》製作的早期，皮克斯大學的一個經理艾利絲？克萊德曼（Elyse　Klaidman）得到一個任務，負責邀請一位魚類專家給還在草創階段的創作班底做講座。

這時，她家的一個房客，亞當？薩默斯（Adam　Summers）正在伯克利作博士後研究，他是這方面有百科全書一樣豐富的知識。克萊德曼邀請他到皮克斯進行一個小時的講座。當他問到為什麼皮克斯會對此有興趣時，克萊德曼只是說：“我不能告訴你。”（皮克斯必須杜絕類似“螞蟻與蟲蟲之爭”的事件的再度發生。）他來到皮克斯，給七八個人講了課，斯坦頓也在其中。兩個半小時以後，他帶著興奮的心情離開了皮克斯，不是因為他是皮克斯的影迷（他以前從沒看過動畫片電影），而是因為他們對他的話題非常感興趣。

“我以前從沒見過這樣的學生，”薩默斯回憶說，“這彷彿是我教過的最好的研究生班。每次我講話不超過三、四分鐘，就會有人舉手提問，而這些問題又會帶出五花八門的新話題。”

幾個星期以後，克萊德曼邀請他定期來皮克斯講課。公司和他簽署了保密協議，然後告訴了他這部電影的內容，並給他看了一些鏡頭。他成了主要的水生動物顧問，常常回來給動畫片中魚類的外觀和動作提建議。　。。

“第500次本壘打”（3）

“我覺得他們真誠地想要聽我給他們的作品挑毛病，”他回憶說，“如果有哪條魚做錯了，他們確實想知道。”

有時候，影片製作者們會脫離學術上的精確，而追求故事本身。一開始，多莉游水的時候是不擺尾巴的——對於她這種魚是對的，因為它們只用鰭移動——但是拉賽特對此表示反對，因為這樣對於觀眾來說缺乏美感。影片中多莉是會擺尾巴的。薩默斯說，如果種群中佔統治地位的母小丑魚死了，公小丑魚就會改變自己的性別。儘管如此，影片中的馬林也沒有改變性別。有一次，薩默斯對某一條魚的動作表示極力反對，負責角色設計的藝術總監裡奇？尼爾瓦（Ricky　Nierva）就提醒他說：“亞當……魚可不會說話。”

真的魚也沒有面部表情。這類表情在《海底總動員》中至關重要，因為魚類角色沒有手臂和肩膀可以擺出姿勢。為了使魚可以表演和表達感情，設計者們在保留他們魚類基本外觀的同時，給他們的面部加入了一些人類的特徵，他們把魚的眼睛放到了前面，加上了具有眉毛作用的肌肉，並且使他們的嘴唇富有彈性。

即使這樣，從整體上說，劇組對於現實是極為尊重的。為了準備製作馬林和多莉被困在鯨魚裡的那組鏡頭，負責陰影效果的藝術總監羅賓？庫珀（Robin　Cooper）和美工師伯特？貝利（Bert　Berry）爬進了一隻在馬林郡北部擱淺死掉的灰鯨的體內。工作人員解剖了死鯨的屍體來研究它的結構——肌肉、心臟、鰓、魚鰾。薩默斯還把其他一些世界級專家請到了皮克斯，其中有斯坦福的馬克？丹尼（Mark　Denny），他做了關於波流的講座；有加州大學聖克魯斯分校的鯨魚研究專家特里？威廉（Terrie　Williams）；有伯克利的馬特？麥克亨利（Matt　McHenry），他來解釋了水母的縮放推進機制；還有咪咪？凱爾（Mimi　Koehl），也來自伯克利，她來詳細講解了水藻和海草的運動。因為大部分海里的生物是半透明的——就是說既不是完全透明的，也不是完全不透明的——杜克大學的松科？約翰遜（Sonke　Johnsen）還做了關於水下半透明物體的講座。另一個專家，來自苔陸海洋實驗室的麥克？格萊厄姆（Mike　Graham）提醒說，巨藻不長在珊瑚礁上，於是，斯坦頓要求重新制作全部有珊瑚礁的鏡頭，剔除巨藻。

海洋本身的樣貌又是一個新的挑戰。在影片技術製作的早期，一個小組在技術總監奧倫？雅各（Oren　Jacob）的指導下，開始提取反映真實海底世界的視覺要素。他們最後得出結論，從觀眾的視角看，這些要素包括：透過海水向下照射的一束束的光、照在海底上變換不定的光、漂移的小碎片、隨著水波和巨浪不停搖擺的植物和因海水的黝暗而隨距離漸褪的顏色。然後，這個小組製作了一系列的軟體工具