司馬,夜奔仲堪,說佺期受朝命,納桓修。仲堪遑遽,即於蕪湖南歸,使徇於玄等軍曰:“若不各散而歸,大軍至江陵,當悉戮餘口。”仲堪將劉系先領二千人隸於佺期,輒率眾而歸。玄等大懼,狼狽追仲堪,至尋陽,及之。於是仲堪失職,倚玄為援,玄等又資仲堪之兵,雖互相疑阻,亦不得異。仲堪與佺期以子弟交質,遂於尋陽結盟,玄為盟主,臨壇歃血,並不受詔,申理王恭,求誅劉牢之、譙王尚之等。朝廷深憚之。於是詔仲堪曰:“間以以將軍憑寄失所,朝野懷憂。然既往之事,宜其兩忘,用乃班師回旆,祗順朝旨,所以改授方任,蓋隨時之宜。將軍大義,誠感朕心,今還複本位,即撫所鎮,釋甲休兵,則內外寧一,故遣太常茂具宣乃懷。”仲堪等並奉詔,各旋所鎮。
頃之。桓玄將討佺期,先告仲堪雲:“今當人沔討除佺期,已頓兵江口。若見與無貳,可殺楊廣;若其不然,便當率軍入江。”仲堪乃執玄兄偉,遣從弟遹等水軍七千至江西口。玄使郭銓、苻宏擊之,遹等敗走。玄頓巴陵,而館其谷。玄又破楊